大鹏湾是臺湾最大的内湾,区内海域之动植物资源丰富,本区特有的红树林-海茄苳及滨海植物如马鞍藤、土沉香、苦林盘等;动物景观以鸟类、鱼类及软甲类为主,出现的鸟种计有九十五种,包括候鸟、过境鸟等,鱼类有石斑等,另外活动于溼地的招潮蟹尤具特色。
小琉球是臺湾附近14个属岛中唯一的珊瑚岛,拥有丰富的海底生态资源。全岛奇岩怪石林立,海洋景观瑰丽。小琉球及大鹏湾大小庙宇近百间,许多庙宇分佈于邻近之东港镇、林边乡及南州乡内,其中以东港镇东隆里之东隆宫为年代最悠久的庙宇,其每三年一次的迎王平安祭,是国内最大型王爷信仰活动。这裡的海鲜全臺闻名,且物美价廉。东港三宝-黑鲔鱼、樱花虾、油鱼子是美食珍宝。小琉球除了香肠独具特色之外(无斩无节),现今最流行的伴手礼就属麻花捲了!